分组法有一定的局限性，虽然在做工程预算工程量方面能提高工作效率，节约做工程预算时间，但在对预算项目组时 ，需要耗费一定的时间，只有对这种做工程预算方法进行成本效益分析后才考虑使用。在工程结算中建筑材料品种多、价格差别大，有时为做工程预算某个材料价格伤透了脑筋。做工程预算过程中可以翻阅材料价格表或数据库，借鉴过去的有关结论，通过比较相近或类似的材料或产品价格，得出合理的数据。例，某信号灯工程中的设备控制器价格就是参照过去做工程预算结论中的价格；有些交通设施的价格就是比较交主管部门制定的赔偿价格来确定的。这种做工程预算方法简单可行，质量高，易被建设各方接受，有事半功倍的效果。适用于对建筑领域的新材料、新设备、新技术或 产品的做工程预算。工程造价做工程预算方法还有很多各有各的优缺点 ，要提高做工程预算效率，关键是要会选择。政府投资项目范围广泛 ，各项目的建设难度、标准也不一致。另外，政府工程经常受到人为因素和自然条件的影响，往往建设时间长，存在较多的设计变更和现场签证 ，有的项目在做工程预算时已经发生变化 ，甚至无法进行现场取证。这些因素决定了工程造价做工程预算具有多样性、复杂性和风险性。因此，选择做工程预算方法时，既要考虑不同的做工程预算阶段和做工程预算内容，还要结合做工程预算目标，注意做工程预算方法之间的交叉使用和外部做工程预算条件的许可，做到有的放矢、科学使用。

涂改原始签证资料或虚列工程项目。有关单位工作人员在送做工程预算资料时，私自涂改原始签证资料或虚列工程项目，企图蒙混过关 ，达到个人的。因此 ，做工程预算人员必须仔细对照原始签证资料，认真核实每一份复印文件的真伪。增加工程是“猫腻”较多的地方 ，究其原因 ，主要是设计单位设计深度不够，建设单位责任心不强。有些承包商在“低价中标法”中不计成本得到工程后，为了弥补损失，千方百计增加工程签证，在利益诱惑下，某些项目管理者乱签证、补签证现象严重 ，做工程预算人员一旦认真复核，通常会发现签证工程量与实际出入较大。安装、装饰及园林工程结算取定的材料单价和市场行情出入很大，有的甚至“偷梁换柱”。例如某国产灯具安装材料套用进口材料价格，工地现场的名贵树种规格和结算书的规格大相径庭，通过现场勘查取证 ，工程造价水分被大大挤压出来。重复签证。重复签证产生的原因有可能是现场管理人员素质不高，对工程定额理解不够；也有可能是管理人员对工程签证缺乏严肃性，不负责任，放弃了监管。例如，某单位在对潜水泵抽水台班签证时，另外又签证了有多少技术工人、普通工人工日。套用定额不准确，套高不套低。例如某大量土方的挖运工程，套用定额时通常只能套用机械挖土方自卸汽车运输的计价子目，但在结算中却套用只能适用少量土方外运的人工装运自卸汽车运输的计价子目，土方造价被大大推高。设计变更增加项目要增加造价，而减少项目的造价却不扣除，反复计算。例如，有的单位在竣工图纸上做足文章，只标注增加部分项目，不标注减少部分项目；有的在送审文件中拿走对其不利的资料，以图蒙混过关，骗取财政资金。私立各种奖励项目，乱发各种奖金。做工程预算中发现，有些建设单位私立各种奖励项目，有合格奖、监理奖、节约奖、组织奖等等，可谓五花八门，通过细查，有的是变相自我嘉奖，有的是奖给下属单位，这些奖大都名不符实，都不应计入工造价。例如，某单位在签订合同时在条款中要求质量等级为“合格”，在另一条款中规定“达到合格等级奖励10万元”，工程质量等级达到合格本应是承包商工程建设的基本要求也是其份内的事情立这样的奖项未免有把公共财政资金拱手送人的嫌疑。